Monitoraggio migliorato dei focolai di intossicazione alimentare da Salmonella con il nuovo test del DNA

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La Salmonella è un batterio gram-negativo, a forma di bastoncello, facoltativo. Zhang et al hanno sviluppato saggi sensibili e specifici per rilevare diversi sierotipi di Salmonella, aprendo la strada a una rapida sierotipizzazione direttamente dai campioni. Credito:Public Health Image Library, Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie, James Archer (2019).

Il test può distinguere in modo rapido e sensibile i sottotipi di Salmonella, riporta il Journal of Molecular Diagnostics.

I ricercatori segnalano lo sviluppo di un test sensibile e specifico per rilevare diversi sierotipi di Salmonella , aprendo la strada a una rapida sierotipizzazione direttamente dai campioni. Questo miglioramento rispetto agli attuali metodi di test può svolgere un ruolo fondamentale nel tracciare rapidamente l'origine dell'infezione. Il rapporto appare nel Journal of Molecular Diagnostics , pubblicato da Elsevier.

Dati recenti dei Centers for Disease Control and Prevention (CDC) indicano che l'intossicazione alimentare causata da Salmonella i batteri portano a 1,35 milioni di infezioni, 26.500 ricoveri e 420 decessi negli Stati Uniti all'anno. Durante un focolaio, la velocità e la semplicità di un test per rilevare tipi specifici di batteri sono importanti per gli investigatori della sanità pubblica per rintracciarne la fonte.

Salmonella in un campione clinico o alimentare può essere presente in quantità molto piccole e quindi richiede metodi molto sensibili per rilevarli. L'amplificazione a spostamento incrociato multiplo (MCDA) è un metodo in grado di rilevare rapidamente quantità molto piccole di DNA e viene eseguito anche a una singola temperatura costante, in contrasto con il ciclo delle temperature richiesto in altri metodi come la PCR. Questo lo rende adatto per un test di rilevamento batterico semplice, rapido e sensibile. Anche se un test MCDA per qualsiasi Salmonella esiste già, non fa distinzione tra diversi sierotipi", ha spiegato il professor Ruiting Lan, PhD, della School of Biotechnology and Biomolecular Sciences dell'Università del New South Wales, Sydney, NSW, Australia.

I ricercatori hanno sviluppato un test MCDA per ciascuno dei sette target sierotipici (sottotipo) di Salmonella . Tutti questi test rilevano accuratamente solo 10 copie di DNA e possono produrre risultati in circa otto minuti. È importante sottolineare che questi test non richiedono apparecchiature di rilevamento specializzate, semplificando qualsiasi applicazione futura in ambienti clinici o industriali. Combinando questi sette saggi sierotipici con il saggio sulle specie esistenti, Salmonella il rilevamento può essere semplificato e accelerato.

“I test sviluppati in questo studio sono unici perché i marcatori genici utilizzati sono stati selezionati sulla base dell'analisi di migliaia di genomi. Quindi, questi marcatori sono a prova di futuro Salmonella la sierotipizzazione nell'era dei test diagnostici indipendenti dalla cultura", ha commentato il professor Lan.

Metodi tradizionali per distinguere la Salmonella i sierotipi implicano la crescita dei batteri dai campioni e quindi il loro test per assegnarli a un sierotipo. Il test MCDA è più veloce perché non richiede prima la crescita dei batteri in coltura. Piuttosto, può rilevare quantità molto piccole di Salmonella DNA.

Anche se ci sono centinaia di Salmonella sierotipi, gli autori hanno scelto i cinque più comuni in Australia, che causano oltre l'85% di Salmonella infezioni in quel paese. Tuttavia, almeno due di questi sierotipi sono anche i migliori Salmonella sierotipi in tutto il mondo, pertanto i ricercatori ritengono che i risultati siano applicabili ad altre regioni geografiche.

Salmonella i batteri vivono tipicamente nell'intestino di animali e umani e vengono eliminati attraverso le feci. Gli esseri umani possono essere infettati dall'ingestione di acqua o cibo contaminato come carne cruda o poco cotta, pollame, uova o prodotti a base di uova. Possibili segni e sintomi di Salmonella l'avvelenamento include nausea, vomito, crampi addominali, diarrea, febbre e mal di testa.

Riferimento:"Rilevamento e sierotipizzazione altamente sensibili e specifici di cinque salmonella prevalenti Sierovars by Multiple Cross-Displacement Amplification” di Xiaomei Zhang, Michael Payne, Qinning Wang, Vitali Sintchenko e Ruiting Lan, 28 aprile 2020, Journal of Molecular Diagnostics .
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.006