El Tomato Genomics Consortium secuenció completamente el genoma del tomate, Solanum Lycopersicum . Informan en el Journal Nature que los tomates poseen unos 35.000 genes dispuestos en 12 cromosomas. Esta investigación proporciona información sobre la evolución de la fruta carnosa y permitirá a los fitomejoradores producir nuevas variedades más rápidamente con las características específicas deseadas.
Por primera vez, el genoma del tomate, Solanum lycopersicum , ha sido decodificado, un paso importante para mejorar el rendimiento, la nutrición, la resistencia a enfermedades, el sabor y el color del tomate y otros cultivos.
La secuencia completa del genoma, así como la secuencia de un pariente silvestre (Solanum pimpinellifolium ), se publica en el número del 31 de mayo de la revista Nature . En concreto, el genoma se secuenció a partir del tomate “Heinz 1706”.
La publicación culmina años de trabajo de los miembros del Tomato Genomics Consortium, una colaboración internacional que incluye a Argentina, Bélgica, China, Francia, Alemania, India, Israel, Italia, Japón, Países Bajos, Corea del Sur, España, Reino Unido y los Estados Unidos. Estados Unidos.
Los investigadores del consorcio informan que los tomates poseen unos 35.000 genes dispuestos en 12 cromosomas. "Para cualquier característica del tomate, ya sea sabor, resistencia natural a plagas o contenido nutricional, hemos capturado prácticamente todos esos genes", dijo James Giovannoni, científico del Instituto Boyce Thompson para la Investigación de Plantas (BTI, que se encuentra en el campus de Cornell) y el Departamento de Agricultura de EE. UU. (USDA), quien dirige el equipo de secuenciación de tomates de EE. UU., que incluye investigadores de nueve universidades, el USDA y el Laboratorio Cold Spring Harbor, donde se desarrolló la secuencia del genoma del tomate silvestre.
Las secuencias de estos genes y su disposición en los cromosomas se describen en el artículo de Nature. “La secuencia del genoma del tomate proporciona información sobre la evolución de la fruta carnosa”, dicen los investigadores en el artículo; también permite a los fitomejoradores producir nuevas variedades más rápidamente con las características deseadas específicas.
"La genética del tomate es la base del potencial para mejorar el sabor que todos los jardineros domésticos conocen y que todos los compradores de supermercados desean, y la secuencia del genoma ayudará a resolver este y muchos otros problemas en la producción y la calidad del tomate", dijo Giovannoni.
Ahora que se conoce la secuencia del genoma de una variedad de tomate, será más fácil y mucho menos costoso para las empresas de semillas y los fitomejoradores secuenciar otras variedades para investigación y desarrollo, agregó. Mientras que la primera secuencia del genoma del tomate costó millones de dólares, las posteriores podrían costar solo $10 000 o menos, si se construyen sobre estos hallazgos iniciales.
En BTI, el científico Lukas Mueller y su equipo crearon un sitio web interactivo para brindar acceso a las secuencias de genes del tomate y especies relacionadas, y Zhangjun Fei y Joyce Van Eck contribuyeron a la secuencia y su trabajo de análisis.
Las fresas, las manzanas, los melones, los plátanos y muchas otras frutas carnosas comparten algunas características con los tomates, por lo que la información sobre los genes y las vías involucradas en la maduración de la fruta se les puede aplicar potencialmente, dijo Giovannoni, lo que ayuda a mejorar la calidad de los alimentos, la seguridad alimentaria y la salud. reducir costos.
“Ahora podemos comenzar a hacer preguntas mucho más interesantes sobre la biología de la fruta, la resistencia a las enfermedades, el desarrollo de las raíces y las cualidades nutricionales”, dijo Giovannoni. Los tomates representan un mercado de $ 2 mil millones solo en los Estados Unidos. El USDA estima que los estadounidenses consumen, en promedio, más de 72 libras de productos de tomate al año.
La secuencia se basa en el trabajo crítico de Steven Tanksley de Cornell y Greg Martin de BTI en la década de 1990. Tanksley, Martin y otros científicos de Ithaca desarrollaron mapas genéticos y otras herramientas moleculares para que los tomates estudiaran los mecanismos de resistencia a enfermedades, y esas herramientas allanaron el camino para los esfuerzos de secuenciación del consorcio, dijo Giovannoni.
Referencias:
"La secuencia del genoma del tomate proporciona información sobre la evolución de la fruta carnosa" por The Tomato Genome Consortium, 30 de mayo de 2012, Nature .
DOI:10.1038/naturaleza11119
“Tú dices tomate” 30 de mayo de 2012, Naturaleza .
DOI:10.1038/485547a
La investigación sobre el genoma y la secuenciación del tomate en los Estados Unidos fue apoyada por la Fundación Nacional de Ciencias y el USDA.
