Amélioration du suivi des épidémies d'intoxication alimentaire à la salmonelle grâce à un nouveau test ADN

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Les salmonelles sont des bactéries anaérobies facultatives à Gram négatif en forme de bâtonnet. Zhang et al ont développé des tests sensibles et spécifiques pour détecter différents sérotypes de Salmonella, ouvrant la voie à un sérotypage rapide directement à partir d'échantillons. Crédit :Public Health Image Library, US Centers for Disease Control and Prevention, James Archer (2019).

Le test peut distinguer rapidement et avec sensibilité les sous-types de Salmonella, rapporte The Journal of Molecular Diagnostics.

Des chercheurs rapportent le développement d'un test sensible et spécifique pour détecter différents sérotypes de Salmonella , ouvrant la voie à un sérotypage rapide directement à partir de spécimens. Cette amélioration par rapport aux méthodes de test actuelles peut jouer un rôle essentiel dans la recherche rapide de l'origine de l'infection. Le rapport apparaît dans le Journal of Molecular Diagnostics , édité par Elsevier.

Des données récentes des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) indiquent que l'intoxication alimentaire causée par Salmonella la bactérie entraîne 1,35 million d'infections, 26 500 hospitalisations et 420 décès aux États-Unis par an. Lors d'une épidémie, la rapidité et la simplicité d'un test pour détecter des types spécifiques de bactéries sont importantes pour que les enquêteurs de santé publique puissent en retrouver la source.

"Salmonelle dans un échantillon clinique ou alimentaire peuvent être présents en très petites quantités et nécessitent donc des méthodes très sensibles pour les détecter. L'amplification par déplacement croisé multiple (MCDA) est une méthode qui peut détecter rapidement de très petites quantités d'ADN et qui est également effectuée à une seule température constante, contrairement au cycle de températures requis dans d'autres méthodes telles que la PCR. Cela en fait un bon choix pour un test de détection bactérienne simple, rapide et sensible. Bien qu'un test MCDA pour toute Salmonella existe déjà, il ne fait pas la distinction entre les différents sérotypes », a expliqué le professeur Ruiting Lan, PhD, de l'École de biotechnologie et des sciences biomoléculaires de l'Université de Nouvelle-Galles du Sud, Sydney, NSW, Australie.

Les chercheurs ont développé un test MCDA pour chacune des sept cibles spécifiques au sérovar (sous-type) de Salmonella . Tous ces tests détectent avec précision aussi peu que 10 copies d'ADN et peuvent produire des résultats en environ huit minutes. Surtout, ces tests ne nécessitent pas d'équipement de détection spécialisé, ce qui simplifie toute application future en milieu clinique ou industriel. En combinant ces sept tests spécifiques au sérovar avec le test d'espèce existant, Salmonella la détection peut être simplifiée et accélérée.

« Les tests développés dans cette étude sont uniques car les marqueurs génétiques utilisés ont été sélectionnés sur la base de l'analyse de milliers de génomes. Ainsi, ces marqueurs à l'épreuve du futur Salmonella sérotypage à l'ère des tests de diagnostic indépendants de la culture », a commenté le professeur Lan.

Méthodes traditionnelles pour distinguer Salmonella les sérotypes impliquent de cultiver les bactéries à partir d'échantillons, puis de les tester pour les attribuer à un sérovar. Le test MCDA est plus rapide car il ne nécessite pas de culture préalable des bactéries en culture. Au contraire, il peut détecter de très petites quantités de Salmonella ADN.

Bien qu'il existe des centaines de Salmonelles sérovars, les auteurs ont choisi les cinq les plus fréquents en Australie, qui causent plus de 85 % des Salmonella infections dans ce pays. Cependant, au moins deux de ces sérovars sont également les principaux Salmonella sérovars à travers le monde, les chercheurs pensent donc que les résultats sont applicables à d'autres régions géographiques.

Salmonelle les bactéries vivent généralement dans les intestins des animaux et des humains et sont éliminées par les matières fécales. Les humains peuvent être infectés en ingérant de l'eau ou des aliments contaminés tels que de la viande crue ou insuffisamment cuite, de la volaille, des œufs ou des ovoproduits. Signes et symptômes possibles de Salmonella les intoxications comprennent des nausées, des vomissements, des crampes abdominales, de la diarrhée, de la fièvre et des maux de tête.

Référence :"Détection et sérotypage hautement sensibles et spécifiques de cinq Salmonella prévalentes Sérovars par amplification à déplacement croisé multiple » par Xiaomei Zhang, Michael Payne, Qinning Wang, Vitali Sintchenko et Ruiting Lan, 28 avril 2020, Journal of Molecular Diagnostics .
DOI :10.1016/j.jmoldx.2020.02.006