Salmonella är gramnegativa, stavformade, fakultativa aneroba bakterier. Zhang et al utvecklade känsliga och specifika analyser för att detektera olika serotyper av Salmonella, vilket banade väg för snabb serotypning direkt från prover. Kredit:Public Health Image Library, US Centers for Disease Control and Prevention, James Archer (2019).
Testet kan snabbt och känsligt särskilja subtyper av Salmonella, rapporterar The Journal of Molecular Diagnostics.
Forskare rapporterar utvecklingen av en känslig och specifik analys för att upptäcka olika serotyper av Salmonella , banar väg för snabb serotypning direkt från prover. Denna förbättring av nuvarande testmetoder kan spela en avgörande roll för att snabbt spåra infektionens ursprung. Rapporten visas i The Journal of Molecular Diagnostics , utgiven av Elsevier.
Nya uppgifter från Centers for Disease Control and Prevention (CDC) indikerar att matförgiftning orsakad av Salmonella bakterier leder till 1,35 miljoner infektioner, 26 500 sjukhusinläggningar och 420 dödsfall i USA per år. Under ett utbrott är hastigheten och enkelheten i ett test för att upptäcka specifika typer av bakterier viktiga för att folkhälsoutredare ska kunna spåra källan.
"Salmonella i ett kliniskt prov eller livsmedelsprov kan förekomma i mycket små mängder och kräver därför mycket känsliga metoder för att upptäcka dem. Multipel korsförskjutningsamplifiering (MCDA) är en metod som kan detektera mycket små mängder DNA snabbt och som också utförs vid en enda konstant temperatur, i motsats till cykling av temperaturer som krävs i andra metoder som PCR. Detta gör den till en bra passform för ett enkelt, snabbt och känsligt bakteriedetekteringstest. Även om ett MCDA-test för någon Salmonella redan existerar, den skiljer inte mellan olika serotyper”, förklarade professor Ruiting Lan, PhD, vid School of Biotechnology and Biomolecular Sciences vid University of New South Wales, Sydney, NSW, Australien.
Utredarna utvecklade en MCDA-analys för vart och ett av de sju serovar (subtyp)-specifika målen för Salmonella . Alla dessa analyser detekterar exakt så få som 10 kopior av DNA och kan ge resultat på cirka åtta minuter. Viktigt är att dessa analyser inte kräver specialiserad detektionsutrustning, vilket förenklar framtida tillämpningar i kliniska eller industriella miljöer. Genom att kombinera dessa sju serovarspecifika analyser med den befintliga artanalysen, Salmonella detektering kan förenklas och påskyndas.
"De analyser som utvecklats i den här studien är unika eftersom de använda genmarkörerna valdes ut baserat på analys av tusentals genom. Dessa markörer framtidssäkrar alltså Salmonella serotypning i en tid präglad av kulturoberoende diagnostiska tester”, kommenterade professor Lan.
Traditionella metoder för att skilja Salmonella serotyper involverar att odla bakterierna från prover och sedan testa dem för att tilldela dem till en serovar. MCDA-testet är snabbare eftersom det inte kräver att bakterierna först odlas i kultur. Snarare kan den upptäcka mycket små mängder Salmonella DNA.
Även om det finns hundratals Salmonella serovar, valde författarna ut de fem vanligast förekommande i Australien, som orsakar mer än 85 procent av Salmonella infektioner i det landet. Men minst två av dessa serovarier är också de bästa Salmonella serovar över hela världen, därför tror forskarna att resultaten är tillämpliga på andra geografiska regioner.
Salmonella Bakterier lever vanligtvis i djurs och mänskliga tarmar och avges genom avföring. Människor kan bli smittade genom att inta kontaminerat vatten eller mat som rått eller dåligt tillagat kött, fågel, ägg eller äggprodukter. Möjliga tecken och symtom på Salmonella förgiftning inkluderar illamående, kräkningar, magkramper, diarré, feber och huvudvärk.
Referens:"Mycket känslig och specifik detektion och serotypning av fem vanliga Salmonella Serovars by Multiple Cross-Displacement Amplification” av Xiaomei Zhang, Michael Payne, Qinning Wang, Vitali Sintchenko och Ruiting Lan, 28 april 2020, Journal of Molecular Diagnostics .
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.006
