Auteur du livre Pandemics, Cynthia a obtenu son D.Phil. en zoologie (biologie évolutive/cognition animale) de l'Université d'Oxford. Son doctorat a été suivi de deux bourses de recherche (à Oxford et au Brésil), ainsi que de divers projets de recherche pour des institutions au Royaume-Uni, aux États-Unis et au Brésil. En tant que scientifique, Cynthia a publié un certain nombre d'articles sur des sujets allant de l'évolution de la cognition avancée et de l'épidémiologie des maladies à la modélisation mathématique des distributions animales en fonction du climat. Elle étudie actuellement la santé et le bien-être des animaux d'élevage.
Une interdiction de la production, du commerce et de la vente d'animaux sauvages destinés à la consommation nous protégerait-elle de futures pandémies ?
La production (ou la chasse), la transformation et la vente d'espèces animales sauvages destinées à la consommation, en particulier dans des conditions de bien-être, de santé et d'hygiène médiocres, amplifient considérablement le risque que des souches virales hébergées par des animaux sauvages soient transmises aux populations humaines. Ce fut le cas, par exemple, avec l'épidémie de SRAS et la pandémie de Covid-19. Cependant, les risques d'épidémies de maladies infectieuses sont loin de se limiter au commerce et à la consommation d'animaux sauvages. Les systèmes d'élevage intensif, où est actuellement produite la majeure partie de la viande dans le monde, créent également des conditions idéales pour l'émergence de souches virales hautement pathogènes, ainsi que le conduit idéal pour l'infection des êtres humains. Ce fut le cas, par exemple, avec la pandémie de grippe (grippe porcine) de 2009, ainsi que les multiples sources de la grippe aviaire hautement pathogène, actuellement une menace majeure pour la santé mondiale. Dans ces derniers cas, les poulets et les porcs ont fait le pont génétique entre le virus sauvage et le virus qui s'est finalement propagé dans la population humaine.
Pourquoi la façon dont nous traitons les animaux, comme les poulets et les porcs, est-elle importante pour les pandémies ?
Parce que des espèces telles que les poulets, les porcs et les vaches agissent comme des hôtes intermédiaires ou amplificateurs où les agents pathogènes peuvent évoluer et se propager aux humains. Nous avons tous appris pendant la pandémie de Covid-19 qu'une bonne santé, un système immunitaire fort, la distanciation sociale, passer du temps au soleil et de bonnes conditions sanitaires sont tous importants pour prévenir et combattre les infections. Le contraire de ces conditions est présent dans la plupart des installations de production animale. Dans ces endroits, de grandes populations d'animaux sont confinées à des densités élevées dans des environnements fermés et stériles. De plus, des niveaux élevés de polluants aériens tels que l'ammoniac et la poussière fécale, qui résultent naturellement de la présence de volumes élevés de déchets animaux, se retrouvent souvent dans ces installations. Sans surprise, la fonction respiratoire des animaux et leurs premières barrières de défense contre les infections sont souvent compromises. Dans les élevages porcins, par exemple, les maladies respiratoires sont répandues, la plupart des porcs souffrant d'une forme de pathologie pulmonaire, y compris la pneumonie, au cours de leur vie. L'immunosuppression induite par le stress chronique (dû au confinement, à l'agressivité, à la privation des comportements naturels et à une mauvaise hygiène) est également une réalité dans ces systèmes. Ces conditions permettent non seulement la transmission rapide des infections mais, plus inquiétant encore, permettent à différentes souches virales de se mélanger dans les hôtes et de combiner leur matériel génétique, ce qui a conduit à maintes reprises à l'émergence de virus qui peuvent également infecter les humains.
Quelles sont les origines des épidémies de maladies infectieuses à potentiel pandémique au cours du siècle dernier ?
La liste suivante décrit l'origine probable des épidémies et pandémies apparues au cours du siècle dernier, toutes associées à la chasse et à la préparation, ou à la production et à la vente, d'animaux destinés à la consommation humaine. Ebola :chauves-souris; VIH :primates; SRAS :chats civettes; SARS-CoV-2 (Covid-19) :pangolins; pandémie de grippe H1N1pdm :porcs; plusieurs foyers de grippe aviaire (grippe aviaire) :poulets.
Qu'est-ce que la résistance aux antibiotiques ?
Les antibiotiques agissent en tuant directement les bactéries ou en réduisant leur capacité à se développer et à se reproduire. Cependant, ils peuvent cesser de fonctionner si les bactéries trouvent des moyens de contrer leurs actions, par exemple en modifiant leur structure afin que l'antibiotique ne les reconnaisse plus, ou en neutralisant directement (par exemple en digérant) l'antibiotique. Ces capacités peuvent être acquises fortuitement par mutation, ou par incorporation de gènes d'autres bactéries possédant de telles capacités. Plus l'exposition aux antibiotiques est importante, plus les chances que les capacités qui confèrent la « résistance » aux antibiotiques se propagent sont grandes.
Qu'est-ce que les animaux d'élevage ont à voir avec la résistance aux antibiotiques ?
Bien qu'une partie du problème soit l'utilisation excessive d'antibiotiques par la population humaine, la plupart des antibiotiques (plus de 70 % dans le monde) ne sont pas utilisés chez l'homme, mais chez les animaux élevés dans des systèmes d'élevage intensif. Dans ces systèmes, les antimicrobiens sont largement utilisés non pas pour traiter les animaux malades (ce qui serait justifiable), mais à titre prophylactique, pour assurer la survie des animaux de santé fragile dans les conditions difficiles des élevages industriels. Sans surprise, des bactéries résistantes aux antimicrobiens ont été isolées chez plusieurs animaux producteurs d'aliments et produits alimentaires dérivés.
Comment la résistance aux antibiotiques se transmet-elle des animaux élevés pour l'alimentation humaine ?
L'une des façons dont les bactéries résistantes aux antibiotiques passent de ces animaux à l'homme est par le biais de produits d'origine animale. Par exemple, les mêmes souches d'Escherichia coli ST131, responsables de millions d'infections chaque année et devenues résistantes à de multiples médicaments, ont été retrouvées sur des échantillons de viande de volaille et de porc vendus dans les épiceries et sur des échantillons d'urine et de sang de patients. diagnostic d'infections extra-intestinales. À Hyderabad, en Inde, des échantillons de viande de poulet vendus dans des magasins de détail se sont révélés contaminés par une superbactérie similaire. Au Brésil, le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) a été identifié dans des échantillons de lait. Dans ce pays, des souches bactériennes résistantes à plusieurs médicaments ont également été identifiées dans la viande de porc et de poulet. En Chine, des gènes identiques conférant une résistance aux antibiotiques à E. coli ont été détectés dans des échantillons de viande vendus au détail et chez des patients humains. Aux États-Unis, 75 % des bactéries que la Food and Drug Administration a trouvées sur la viande des épiceries étaient résistantes aux antibiotiques. La contamination environnementale est une autre voie de transmission. Les bactéries peuvent pénétrer dans les plans d'eau et le sol et contaminer d'autres produits agricoles en utilisant des déchets animaux comme engrais.
